La región bonaerense estaba poblada hace un siglo por una rica variedad de especies, cuya gran mayoría es hoy difícil de encontrar.

Entre los mamíferos habían ciervos exóticos, venados, guanacos, jabalíes, gatos monteses, gato de los pajonales, pumas, hurones, zorros grises, mulitas, peludos, zorrinos, matacos, nutrias, tucutucos, cuises, liebres, conejos, vizcachas, comadrejas y carpinchos.

El yaguareté o el tigre se encuentran casi totalmente extinguidos. Sólo el murciélago se ha adaptado a las ciudades, donde encuentra insectos para su alimentación y escondites para ocultarse del hombre.

Entre las aves se destaca el chimango, el ñandú y el carancho así como patos, garzas y flamencos. Asimismo, el tero, la martineta, el chajá, el loro, y diversidad de pájaros como el picaflor, el benteveo, el torno, el chorlo y el hornero.

También se encuentra una gran variedad de reptiles como la peligrosa víbora yarará, lagartos verdes, tortugas, iguanas y batracios.

A diferencia de la fauna terrestre, la marina es muy rica y se puede acceder a ella por casi toda la costa de Buenos Aires. Entre los mamíferos acuáticos destacan el delfín del Plata, que habita en el río, y el delfín azul, conocido con el nombre de tonina.